• Le vaccin actuel est la seule mesure préventive existante contre l'hépatite B.
• Il permet d'éviter l'apparition d'un cancer du foie.
• En vaccinant les gens, on empêche la transmission du virus, ce qui permettra à terme d'éradiquer le virus.
• Les études actuelles ne montrent aucun lien de causalité entre la sclérose en plaques et l'hépatite B.
  Argument contesté par les patients, par des études peu médiatisées et par l'étude Hernan parue le 14 septembre 2004.
• Les enfants n'ont aucun risque de développer une SEP puisque leur système immunitaire n'est pas assez mature.
  Argument contesté par certains médecins, certaines études et certains experts qui parlent d'enfants ayant développé les symptômes d'une SEP.

Certains médecins pensent que le vaccin ne provoque pas une SEP mais ne fait qu'accélérer son apparition.
D'autres réfutent tout lien et affirment qu'il s'agit de simples coïncidences si des personnes développent des SEP après une vaccination.
Des personnes pensent également que ce n'est pas le vaccin qui est en cause mais les adjuvants utilisés pour le vaccin - le thiormersal ou l'oxyde d'aluminium déjà à l'origine d'une autre maladie neurologique autoimmune - qui seraient à l'origine d'une survenue de SEP.